北京时间8月29日凌晨零点，欧足联在摩纳哥进行了08-09赛季欧洲冠军联赛小组赛抽签仪式。32强被分入8个小组，其中拥有里昂、拜仁、佛罗伦萨的F组以及皇马、尤文、圣彼得堡泽尼特所在的H组被认为是最艰难的两个小组。
　　
　　欧足联随后公布了欧冠小组赛阶段的对阵及赛程排列，具体形势如下：
　　
　　注：所有日期均为欧洲时间。
　　
　　第一比赛日 2008年9月16日
　　切尔西VS波尔多
　　罗马VS克鲁日
　　帕纳辛奈科斯VS国际米兰
　　不莱梅VS阿诺索西斯
　　巴塞尔VS顿涅茨克矿工
　　巴塞罗那VS里斯本竞技
　　埃因霍温VS马德里竞技
　　马赛VS利物浦
　　
　　 2008年9月17日
　　曼联VS比利亚雷亚尔
　　凯尔特人VS阿尔堡
　　布加勒斯特星VS拜仁慕尼黑
　　里昂VS佛罗伦萨
　　波尔图VS费内巴切
　　基辅迪纳摩VS阿森纳
　　尤文图斯VS圣彼得堡泽尼特
　　皇家马德里VS巴特
　　
　　 第二比赛日 2008年9月30日
　　阿尔堡VS曼联
　　比利亚雷亚尔VS凯尔特人
　　佛罗伦萨VS布加勒斯特星
　　拜仁慕尼黑VS里昂
　　阿森纳VS波尔图
　　费内巴切VS基辅迪纳摩
　　巴特VS尤文图斯
　　圣彼得堡泽尼特VS皇家马德里
　　
　　 2008年10月1日
　　克鲁日VS切尔西
　　波尔多VS罗马
　　阿诺索西斯VS帕纳辛奈科斯
　　国际米兰VS不莱梅
　　里斯本竞技VS巴塞尔
　　顿涅茨克矿工VS巴塞罗那
　　利物浦VS埃因霍温
　　马德里竞技VS马赛
　　
　　第三比赛日 2008年10月21日
　　比利亚雷亚尔VS阿尔堡
　　曼联VS凯尔特人
　　拜仁慕尼黑VS佛罗伦萨
　　布加勒斯特星VS里昂
　　费内巴切VS阿森纳
　　波尔图VS基辅迪纳摩
　　圣彼得堡泽尼特VS巴特
　　尤文图斯VS皇家马德里
　　
　　2008年10月22日
　　波尔多VS克鲁日
　　切尔西VS罗马
　　国际米兰VS阿诺索西斯
　　帕纳辛奈科斯VS不莱梅
　　顿涅茨克矿工VS里斯本竞技
　　巴塞尔VS巴塞罗那
　　马德里竞技VS利物浦
　　埃因霍温VS马赛
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